女性小肚子两侧疼可能与多种原因有关，如排卵痛、异位妊娠、盆腔炎性疾病、卵巢囊肿蒂扭转等。具体如下：
1.排卵痛：通常发生在两次月经中间，一般历时数小时，可伴有轻微的下腹部疼痛、肛门坠胀感，可能与排卵时卵巢表面发生破裂有关。
2.异位妊娠：是指受精卵在子宫体腔以外的部位着床，其中以输卵管妊娠最为常见。典型症状为停经后腹痛与阴道流血，当发生输卵管妊娠流产或破裂时，会引起一侧下腹部撕裂样疼痛，常伴有恶心、呕吐。
3.盆腔炎性疾病：是女性上生殖道感染引起的一组疾病，包括子宫内膜炎、输卵管炎、输卵管卵巢脓肿和盆腔腹膜炎。炎症可局限于一个部位，也可同时累及几个部位，多发生在性活跃期、有月经的妇女。主要表现为下腹部疼痛、阴道分泌物增多，腹痛为持续性，活动或性交后加重。
4.卵巢囊肿蒂扭转：是指供应卵巢囊肿的血管发生了扭转，使卵巢囊肿缺血，甚至坏死破裂，引起剧烈腹痛。卵巢囊肿蒂扭转好发于瘤蒂长、中等大、活动度良、重心偏于一侧的囊性肿瘤，多发生在体位急骤变动时、妊娠期或产后。
5.其他：女性小肚子两侧疼还可能与其他因素有关，如腹部受凉、肠痉挛、输尿管结石等。
总之，女性小肚子两侧疼可能是一种正常的生理现象，也可能是某些疾病的表现。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，以便明确病因并进行针对性治疗。