根据大拇指指甲根部凹陷的情况，可能是由以下原因引起：
1.营养不良：指甲是由蛋白质组成的，如果身体缺乏蛋白质、铁、钙等营养物质，指甲就可能会出现凹陷。
2.真菌感染：灰指甲是由真菌感染引起的，会导致指甲变厚、变色、变形，甚至出现凹陷。
3.银屑病：银屑病是一种自身免疫性疾病，会导致皮肤和指甲出现病变，指甲可能会出现凹陷、增厚、变色等症状。
4.扁平苔藓：扁平苔藓是一种慢性炎症性皮肤病，会导致皮肤和指甲出现病变，指甲可能会出现凹陷、变薄、变色等症状。
5.其他原因：指甲受到外伤、化学物质刺激、长期接触水或其他物质等，也可能会导致指甲出现凹陷。
如果发现大拇指指甲根部凹陷，建议及时就医，进行相关检查，以确定病因，并采取相应的治疗措施。同时，平时要注意保持指甲的清洁卫生，避免长时间接触水或化学物质，避免指甲受到外伤。
对于特殊人群，如孕妇、儿童、老年人等，指甲根部凹陷的原因可能会有所不同，需要更加注意。孕妇在怀孕期间，由于体内激素水平的变化，指甲可能会出现凹陷等异常，但一般不需要特殊治疗。儿童指甲根部凹陷可能与营养不良、感染等有关，需要及时就医，进行相关检查和治疗。老年人指甲根部凹陷可能与营养不良、退行性疾病等有关，需要更加关注身体健康，及时就医，进行相关检查和治疗。
总之，大拇指指甲根部凹陷可能是由多种原因引起的，如果发现这种情况，建议及时就医，进行相关检查和治疗，以确定病因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意保持指甲的清洁卫生，避免指甲受到外伤，保持良好的生活习惯和饮食习惯，有助于预防指甲病变的发生。