亚急性甲状腺炎与病毒感染有关，属自限性疾病。针对两个主要症状，即炎症病灶部位疼痛及甲状腺功能异常，分别采取相应治疗措施。
1.对症治疗：有发热和颈部疼痛显著者，可给予乙酰水杨酸、非甾体类抗炎药或糖皮质激素等缓解症状。
使用非甾体类抗炎药的原因：亚急性甲状腺炎是一种与病毒感染有关的自限性疾病，发病前常有上呼吸道感染病史，病毒感染可导致炎症因子释放，从而引起疼痛。非甾体类抗炎药可通过抑制环氧化酶活性，减少前列腺素合成而具有抗炎、止痛作用。
使用糖皮质激素的原因：糖皮质激素具有强大的抗炎作用，可迅速缓解甲状腺疼痛，减轻炎症早期的局部水肿和渗出，但停药后容易复发，且停药后激素减量过快或突然停药可能导致“反跳”而使病情加重，因此一般不单独使用，多与非甾体类抗炎药联合使用，待症状缓解后逐渐减量。
2.针对甲状腺功能异常所采取的治疗措施：
一过性甲状腺毒症期：无需抗甲状腺药物治疗，症状明显者可用β受体阻滞剂改善甲亢症状。
甲减期：通常不需要甲状腺激素替代治疗，可自行恢复，症状明显者可用甲状腺激素替代治疗。
恢复期：甲功恢复正常后，停药观察。
亚急性甲状腺炎是一种可自愈的疾病，但在疾病发展过程中可能会出现疼痛、发热等不适，影响生活质量。因此，如果出现相关症状，建议及时就医，在医生的指导下进行治疗。