牙齿开髓引流一般规范操作下危害较小，但如果操作不当可能存在一些问题。正常来说，开髓引流是治疗牙髓炎等疾病的常用方法，一般规范进行不会有严重危害，但要是操作不规范可能出现感染扩散等情况。
术后感染风险
局部感染扩散： 如果在开髓引流过程中，消毒不严格，有可能导致细菌从开髓部位扩散到周围组织。比如细菌可能顺着牙髓腔蔓延到根尖周组织，引发更严重的根尖周炎，不过这种情况在正规医疗机构中通过严格无菌操作是可以大大降低发生概率的。一般正规操作下，感染扩散的概率低于5%。全身感染： 极个别情况下，细菌可能通过血液系统传播到全身，引起菌血症等全身感染性疾病，但这种情况非常罕见，发生率低于0.1%。
疼痛方面影响
短暂疼痛加重： 在开髓引流后的短时间内，部分患者可能会有短暂的疼痛加重情况。这是因为开髓后牙髓腔压力突然释放，周围组织受到刺激，一般这种疼痛会在1 - 2天内逐渐缓解。如果疼痛持续超过3天且逐渐加重，就需要及时复诊。
对牙齿结构的影响
牙齿强度降低： 开髓引流会去除部分牙髓组织和牙体硬组织，可能会使牙齿的强度有所降低。不过后续会通过补牙等措施进行修复，只要后续修复得当，一般不影响牙齿的正常使用功能。例如，开髓后及时进行合适的充填修复，牙齿可以继续行使咀嚼等功能，对牙齿整体结构的长期影响较小。但如果不及时修复，牙齿可能会因为受力等原因出现折裂等情况。