先天性胆总管囊肿多是由于胚胎时期胆管发育异常导致的胆道畸形，以腹痛、包块、黄疸为主要临床表现。具体如下：
1.腹痛：多数患者在右上腹肋缘下有肿块，呈椭圆形囊性，光滑，质软，有囊性感，无压痛，可移动。当囊肿发生感染或形成脓肿时，可有明显的腹痛、寒战、高热。
2.包块：约半数以上的先天性胆总管囊肿患者可在上腹部触及囊性肿块，多位于右上腹肋缘下，表面光滑，有囊性感，无压痛，可移动。
3.黄疸：部分患者可出现黄疸，多为间歇性或进行性加重，常伴有瘙痒。
4.其他：少数患者可出现胆道感染、胰腺炎、门静脉高压等并发症。
需要注意的是，先天性胆总管囊肿的临床表现可能因个体差异而有所不同，部分患者可能无明显症状，仅在体检时发现。如果怀疑有先天性胆总管囊肿，应及时就医，进行相关检查，如B超、CT、磁共振胰胆管造影（MRCP）等，以明确诊断。一旦确诊，应及时进行手术治疗，以免延误病情。