扁桃体摘除手术一般较为安全，极少数情况下可能出现一些术后并发症，但这些并发症发生概率较低，且可采取适当的治疗措施。以下是一些可能的扁桃体摘除手术后遗症：
1.出血：手术中或手术后可能出现出血，需要再次止血。
2.感染：手术后可能会发生感染，需要使用抗生素治疗。
3.疼痛：手术后可能会有一段时间的喉咙疼痛，可以通过药物缓解。
4.吞咽困难：手术后可能会因为喉咙疼痛而导致吞咽困难，这是正常的，随着时间的推移会逐渐改善。
5.呼吸困难：在极少数情况下，手术后可能会出现呼吸困难，需要及时就医。
6.对免疫力的影响：扁桃体是免疫系统的一部分，摘除后可能会对免疫力有一定影响，但这种影响通常是暂时的，身体会逐渐适应。
需要注意的是，这些后遗症并不是一定会发生的，而且发生的概率较低。在决定是否进行扁桃体摘除手术之前，患者应该与医生充分沟通，了解手术的风险和收益，并根据自己的情况做出决定。