巴氏腺囊肿主要是由于巴氏腺管开口阻塞，分泌物积聚而形成。巴氏腺是位于女性大阴唇后部的一对腺体，正常情况下腺体分泌的液体通过巴氏腺管排出，如果管腔被堵塞，分泌物就会潴留形成囊肿。
巴氏腺管阻塞的原因一：炎症因素
感染引发炎症： 当女性的外阴受到病原体感染时，比如阴道炎、宫颈炎等炎症蔓延至巴氏腺，就可能导致巴氏腺管发炎。例如，常见的葡萄球菌、大肠杆菌、链球菌等病原体感染，会使巴氏腺管黏膜充血、肿胀，进而阻塞管腔。一般在妇科炎症发作后的一段时间内，就有可能出现巴氏腺管阻塞的情况。急性期炎症未彻底治愈： 巴氏腺发生急性炎症时，如果没有得到及时、彻底的治疗，炎症消退后，腺管瘢痕挛缩也会引起阻塞。比如急性巴氏腺炎发作后，虽然经过治疗症状有所缓解，但腺管可能已经因为炎症损伤出现了狭窄或阻塞。
巴氏腺囊肿的原因二：腺管损伤
分娩时的损伤： 在分娩过程中，会阴部位的裂伤可能会波及巴氏腺管。比如顺产时，胎儿通过产道，可能会导致巴氏腺管受到压迫、损伤，之后形成瘢痕，引起管腔阻塞。这种情况在经产妇中相对更常见一些，因为经产妇经历过多次分娩，会阴部位受到损伤的几率相对较高。妇科手术影响： 进行一些妇科手术时，也可能损伤巴氏腺管。例如，做会阴侧切术等手术时，如果操作不当，有可能损伤到巴氏腺管，术后如果恢复不佳，就容易出现巴氏腺管阻塞，进而形成囊肿。
巴氏腺囊肿的原因三：其他因素
先天性腺管狭窄： 部分女性可能存在先天性的巴氏腺管狭窄或腺管开口异常，这就使得分泌物排出不畅，长期积聚后形成囊肿。这种情况从出生时就存在一定的解剖结构异常，但可能在青春期后或性生活活跃期才会逐渐表现出症状。不良卫生习惯： 长期不注意外阴局部卫生，也可能增加巴氏腺囊肿的发生风险。比如不经常清洗外阴、不勤换内裤等，导致外阴局部细菌滋生，容易引发巴氏腺管的感染，进而阻塞管腔。一般长期保持不良卫生习惯的人群，患病几率会比卫生习惯良好的人群相对高一些。