克罗恩肠炎是一种慢性炎性肉芽肿性肠道疾病，其症状多样。一般来说，患者可能会出现腹痛，多位于右下腹或脐周，间歇性发作；还可能有腹泻，粪便多为糊状，一般无脓血或黏液，每日可达2 - 10次不等。
消化系统症状表现
腹痛： 多为隐痛或钝痛，常在进餐后加重，可能与胃肠蠕动增加或肠内容物通过病变肠段引起局部肠痉挛有关。疼痛部位多与病变部位相关，如病变在回肠末端主要表现为右下腹疼痛；病变在结肠部位则可能出现左下腹或下腹疼痛。腹泻： 腹泻是常见症状之一，发病初期腹泻可能为间歇性发作，随着病情进展可转为持续性。腹泻的原因与肠道炎症导致的吸收不良、肠道运动功能紊乱等有关。有些患者每天腹泻次数较多，严重影响生活质量。
全身症状表现
发热： 部分患者会出现发热症状，可为低热或中度热，少数患者可出现高热。发热多是由于肠道炎症活动或继发感染引起。一般来说，肠道炎症活动越明显，发热的概率相对越高。营养不良： 由于肠道吸收功能障碍以及慢性炎症消耗等原因，患者可能出现体重下降、消瘦、贫血等营养不良表现。长期营养不良会导致患者身体抵抗力下降，更容易并发其他感染等问题。比如儿童患者如果患有克罗恩肠炎，可能会出现生长发育迟缓的情况。
肠道外表现
关节症状： 部分患者会出现关节疼痛、肿胀等关节症状，以大关节受累较为常见，如膝关节、踝关节等。关节症状多与肠道炎症活动相关，肠道炎症控制后，部分患者关节症状可缓解。皮肤表现： 可能出现结节性红斑、坏疽性脓皮病等皮肤病变。结节性红斑多表现为下肢伸侧的红色结节，伴有疼痛；坏疽性脓皮病则表现为皮肤的溃疡、坏死等改变。这些皮肤表现也是克罗恩肠炎肠道外表现的一部分，其发生机制可能与自身免疫等因素有关。