咽喉是咽与喉的统称，咽位于消化道和呼吸道的交会处，喉位于气管上，是呼吸的通道也是发声器官。喝水时感觉咽喉刺痛，主要考虑与以下几种疾病有关。
1.感染性疾病：
咽炎：咽部黏膜、黏膜下组织及其淋巴组织的炎症，可单独发生，亦可继发于急性鼻炎、急性扁桃体炎。患者多有咽部干燥、灼热、疼痛，吞咽疼痛明显，可放射至耳部。
扁桃体炎：腭扁桃体的非特异性炎症，可分为急性扁桃体炎和慢性扁桃体炎。急性扁桃体炎多伴有畏寒、高热、头痛等全身症状，吞咽时疼痛加剧。
会厌炎：会厌黏膜的炎症，可单独发生，亦可继发于急性扁桃体炎、急性咽炎。患者多有畏寒、发热、乏力等全身症状，会厌高度水肿时可引起吸气性呼吸困难。
急性喉炎：喉黏膜及声带的急性炎症，多继发于上呼吸道感染，亦可单独发生。患者主要表现为声音嘶哑、喉部疼痛、咳嗽等症状。
2.外伤：
咽部异物：进食时误吞鱼刺、鸡骨等异物，可导致咽部黏膜损伤，引起疼痛。
咽部划伤：进食过快、过猛，或食用辛辣、坚硬的食物，可导致咽部黏膜划伤，引起疼痛。
3.其他：
反流性食管炎：胃酸反流刺激食管和咽喉部黏膜，可引起烧心、反流、咽痛等症状。
咽部肿瘤：如扁桃体恶性肿瘤、下咽癌等，可导致咽部疼痛，吞咽时加重。
如果喝水时感觉咽喉刺痛，建议及时就医，明确病因，在医生的指导下进行治疗。同时，应注意休息，多喝水，避免食用辛辣、刺激性食物，保持口腔清洁。