人流后月经不调的原因较多，一般来说，约15% - 25%的女性在人流后会出现月经不调情况。
内分泌紊乱因素
激素水平波动：人流会使女性体内的激素水平急剧变化，比如人绒毛膜促性腺激素（hCG）迅速下降，这可能影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的正常功能。一般在人流后的1 - 2个月内，激素水平可能还未完全恢复到孕前状态，从而导致月经不调。泌乳素变化：部分女性人流后泌乳素可能会短暂升高，泌乳素升高会干扰正常的月经周期，使得月经出现推迟、经量异常等情况。
子宫内膜损伤因素
内膜基底层受损：人流过程中如果刮宫过度，容易损伤子宫内膜的基底层。子宫内膜基底层受损后，内膜的修复会受到影响，可能导致月经量减少、月经周期紊乱。通常内膜基底层受损严重时，可能需要数月甚至更长时间来恢复，在此期间月经会一直处于不调状态。宫腔粘连：人流后发生宫腔粘连也是导致月经不调的重要原因。宫腔粘连会使宫腔部分或完全闭塞，影响经血的排出，表现为月经量明显减少，甚至闭经，而且月经周期也会变得紊乱。
心理因素影响
精神压力过大：人流后女性可能会有较大的精神压力，比如担心身体恢复情况、害怕影响今后生育等。长期的精神紧张会通过神经内分泌系统影响月经，导致月经不调。有研究发现，约30%因心理压力大导致月经不调的女性，在压力缓解后月经会逐渐恢复，但也有部分人需要较长时间来调整。情绪波动剧烈：人流后情绪可能会出现较大波动，如焦虑、抑郁等。情绪的剧烈变化会干扰下丘脑分泌激素，进而影响卵巢的排卵和月经周期，使得月经出现提前、推迟或经量异常等情况。