女性在生完孩子后来月经时肚子痛，可能是由以下几种原因引起的：
1.子宫收缩：在生完孩子后，子宫需要一定的时间来恢复到正常大小。在月经期间，子宫会收缩以排出经血，这可能会导致肚子痛。
2.子宫内膜异位症：这是一种常见的妇科病，指子宫内膜组织生长在子宫腔以外的部位。它可能会导致月经期间肚子痛、性交痛等症状。
3.盆腔炎：盆腔炎是指女性生殖器官、子宫周围结缔组织及盆腔腹膜的炎症。它可能会导致月经期间肚子痛、白带异常、性交痛等症状。
4.子宫肌瘤：子宫肌瘤是子宫平滑肌组织增生形成的良性肿瘤，可能会导致月经期间肚子痛、月经量增多、经期延长等症状。
5.其他：如宫颈炎、阴道炎等妇科炎症，也可能会导致月经期间肚子痛。
如果女性在生完孩子后来月经时肚子痛，建议及时就医，进行相关检查，以确定病因，并采取相应的治疗措施。同时，女性在月经期间应注意保暖，避免食用辛辣、生冷等刺激性食物，保持心情愉悦，避免过度劳累。