儿童早晨起床咳嗽，可能是以下原因引起：
1.上气道咳嗽综合征：由于鼻部疾病引起分泌物倒流至鼻后和咽喉等部位，直接或间接刺激咳嗽感受器，导致以咳嗽为主要表现的综合征被称为上气道咳嗽综合征。除咳嗽外，还可能伴有鼻塞、流涕、打喷嚏等症状。治疗方法包括使用生理盐水清洗鼻腔、使用鼻用糖皮质激素等。
2.咳嗽变异性哮喘：咳嗽变异性哮喘以咳嗽为主要表现，多为刺激性干咳，通常咳嗽比较剧烈，夜间咳嗽为其重要特征。常因上呼吸道感染、运动、冷空气、接触过敏原等诱发。治疗方法包括使用支气管舒张剂、糖皮质激素等。
3.胃食管反流病：胃内容物反流到食管上括约肌以上部位，可导致以咳嗽为突出表现的综合征，称为胃食管反流病。除咳嗽外，还可能伴有烧心、反酸、嗳气等症状。治疗方法包括调整饮食、使用促胃肠动力药、抑酸药等。
4.感染后咳嗽：急性呼吸道感染，在咳嗽症状消失后，咳嗽仍然迁延不愈，多为刺激性干咳或咳少量白色黏液痰，通常持续3～8周，胸部X线片检查无异常。感染后咳嗽具有自限性，通常不需要使用抗菌药物治疗。
5.其他：心因性咳嗽、变应性咳嗽、药物相关性咳嗽等也可能导致儿童早晨起床咳嗽。
如果儿童早晨起床咳嗽持续时间较长或伴有其他症状，建议及时就医，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，家长应注意保持室内空气湿润，避免孩子接触过敏原，鼓励孩子多喝水，多吃新鲜的蔬菜和水果。