宝宝睡觉时摇头可能由以下原因引起：
1.正常生理现象：宝宝的神经系统尚未完全发育成熟，有时摇头是一种自然的反应。此外，宝宝的头部容易出汗，如果睡觉时头部过热，也可能导致摇头。
2.缺钙：宝宝缺钙时，头部会瘙痒，也会出现摇头的现象。同时，还可能伴有多汗、夜惊、烦躁等症状。
3.湿疹：如果宝宝头部有湿疹，会因瘙痒而摇头。湿疹可能还会出现在其他部位，如脸部、颈部等。
4.外耳道炎或中耳炎：如果宝宝的外耳道有耵聍（耳屎）或受到感染，会因耳部不适而摇头。此外，中耳炎也可能导致宝宝摇头，同时还可能伴有耳部疼痛、发热等症状。
5.皮肤过敏：宝宝对床上用品、衣物或空气中的某些物质过敏，也可能导致头部瘙痒，引起摇头。
6.其他：宝宝可能因内耳发育不完善、消化不良、头皮感染等原因而摇头。
如果宝宝只是偶尔摇头，且没有其他异常表现，可能是正常的。但如果摇头频繁，或伴有其他症状，如哭闹、睡眠不安、食欲不振等，应及时带宝宝就医，进行相关检查，以确定原因并采取相应的治疗措施。
需要注意的是，不建议家长自行给宝宝使用药物，以免引起不良反应。同时，要保持宝宝的头部清洁，及时修剪指甲，避免宝宝搔抓头部。如果宝宝的症状持续不缓解或加重，应及时就医。