宝宝睡觉时摇头可能由以下原因引起：
1.正常的生理现象：宝宝的前庭功能尚未发育完全，摇头可能是一种自我安抚的行为。
2.湿疹：宝宝头部出汗多，若没有及时清理，会导致头皮瘙痒，从而引起摇头。
3.缺钙：宝宝生长发育迅速，若钙摄入不足，可能导致神经兴奋性增加，出现多汗、摇头等症状。
4.头皮感染：宝宝的头皮若受到细菌或真菌感染，可能会出现炎症，导致瘙痒，从而引起摇头。
5.中耳炎：宝宝的咽鼓管较短、宽且平直，呈水平位，若发生上呼吸道感染，容易并发中耳炎，从而引起宝宝摇头。中耳炎还可能伴有耳部流脓、发烧等症状。
如果宝宝只是偶尔摇头，精神状态良好，吃奶、睡眠正常，可能是正常的生理现象。但若宝宝摇头频繁，或伴有其他异常表现，如哭闹、烦躁、夜惊、多汗、枕秃等，应及时就医，明确原因。