治疗灰指甲的药物有很多，以下是一些常用的药物：
1.外用药物：
阿莫罗芬搽剂：这是一种广谱抗真菌药物，能有效抑制灰指甲的病原菌。使用时，先将病甲锉薄，然后涂抹阿莫罗芬搽剂，每天1-2次。需要注意的是，阿莫罗芬搽剂需要使用一段时间才能见到效果，一般需要连续使用6-12个月。
环吡酮胺乳膏：也是一种广谱抗真菌药物，对灰指甲有较好的治疗效果。使用方法与阿莫罗芬搽剂类似，将病甲锉薄后涂抹乳膏，每天1-2次。
特比萘芬酊：特比萘芬是一种丙烯胺类广谱抗真菌药物，对皮肤癣菌有杀菌作用。使用时，将病甲用锉刀锉薄，然后用特比萘芬酊涂抹，每天1-2次。特比萘芬酊的刺激性较小，适合儿童和老年人使用。
2.口服药物：
伊曲康唑胶囊：伊曲康唑是一种广谱抗真菌药物，对灰指甲有较好的治疗效果。一般采用间歇冲击疗法，即每个月服用1-2周，连续服用3-6个月。使用伊曲康唑胶囊时需要注意药物的副作用，如肝功能损害等，因此在治疗期间需要定期检查肝功能。
特比萘芬片：特比萘芬是一种丙烯胺类广谱抗真菌药物，对灰指甲有较好的治疗效果。用法与伊曲康唑胶囊类似，也是采用间歇冲击疗法，每个月服用1-2周，连续服用3-6个月。特比萘芬片的副作用较小，对肝功能的影响较小，但价格相对较高。
需要注意的是，灰指甲的治疗需要一定的时间，一般需要连续用药3-6个月才能彻底治愈。在治疗期间，要注意个人卫生，保持足部清洁干燥，避免与他人共用鞋袜、拖鞋等物品，以防交叉感染。同时，要注意药物的副作用，如果出现严重的不良反应，应及时就医。