怀孕三个月发烧，可能由细菌、病毒感染等引起，可能对孕妇和胎儿造成不良影响，应及时就医，以下是一些应对方法：
1.就医检查：告知医生怀孕情况，进行全面检查，如血常规、尿常规、C反应蛋白等，以确定发烧的原因。
2.一般治疗：注意休息，保持室内空气流通，多饮水，补充维生素C等。
3.药物治疗：如果发烧超过38.5°C，医生可能会根据具体情况开具对乙酰氨基酚等退烧药。需注意，应在医生指导下使用药物，避免自行用药。
4.对因治疗：如果发烧是由细菌感染引起，可能需要使用抗生素治疗；如果是病毒感染，通常会在一周左右自愈，以对症治疗为主。
5.其他治疗：医生可能会根据病情采取物理降温等方法，如温水擦浴、冷敷等。
此外，在治疗过程中，孕妇应密切关注自身和胎儿的情况，如有异常应及时告知医生。同时，应避免接触有害物质，如放射线、化学毒物等，保持良好的生活习惯，如均衡饮食、适量运动等。
需要注意的是，以上内容仅供参考，具体治疗方案应根据个人实际情况在医生的指导下进行。