怀孕后发现卵巢囊肿，不用太过惊慌，可先进行观察，根据囊肿的性质、大小、症状等，采取不同的处理措施，具体如下：
1.观察：如果囊肿较小，没有明显症状，且为生理性囊肿，通常会在怀孕3个月后自行消失，无需特殊处理，可定期复查。
2.终止妊娠：如果囊肿较大，或怀疑为恶性肿瘤，或引起了明显的腹痛、腹胀等症状，可能会对胎儿和孕妇造成不良影响，需要及时终止妊娠，并进行手术治疗。
3.手术治疗：如果囊肿较小，没有明显症状，但在观察过程中逐渐增大，或怀疑为恶性肿瘤，或引起了严重的并发症，需要进行手术治疗。手术方式包括囊肿剔除术、患侧卵巢切除术等。手术时需要尽量保留卵巢功能，以减少对孕妇的影响。
4.其他治疗：如果囊肿较小，没有明显症状，且为良性肿瘤，也可以采取药物治疗、中医治疗等方法进行保守治疗。
需要注意的是，怀孕后发现卵巢囊肿，应及时就医，在医生的指导下进行治疗。同时，孕妇应保持良好的心态，注意休息，避免剧烈运动和性生活，以保障自身和胎儿的健康。