怀孕期间发现卵巢囊肿是否会影响胎儿，需要根据囊肿的性质、大小、位置以及孕妇的具体情况来综合判断。一般来说，以下几种情况需要引起重视：
生理性囊肿：怀孕后，卵巢可能会出现黄体囊肿等生理性囊肿，这类囊肿通常会在孕期自行消退，不会对胎儿造成影响。
良性肿瘤：如果卵巢囊肿是良性的，且体积较小，一般也不会对胎儿产生明显影响。但需要定期复查，观察囊肿的变化情况。
恶性肿瘤：如果卵巢囊肿是恶性的，或者短期内迅速增大，可能会对胎儿产生不良影响，如引起流产、早产等。此外，恶性肿瘤还可能影响孕妇的健康。
囊肿蒂扭转或破裂：如果卵巢囊肿较大，或者发生了蒂扭转或破裂，可导致孕妇腹痛、恶心、呕吐等症状，甚至引起流产或早产。
其他情况：某些情况下，卵巢囊肿可能会影响孕妇的激素水平，导致孕期并发症的发生。
因此，怀孕期间发现卵巢囊肿，需要及时就医，进行详细的检查和评估。医生会根据囊肿的具体情况，以及孕妇的个体差异，制定个性化的治疗方案。在孕期，孕妇应注意休息，避免剧烈运动和性生活，同时按照医生的建议进行定期复查，以确保自身和胎儿的健康。
需要注意的是，对于有卵巢囊肿病史的女性，在备孕前应进行详细的孕前检查，包括卵巢功能评估等，以了解囊肿的情况，并在医生的指导下备孕。此外，孕期发现卵巢囊肿时，应避免自行用药或采取不恰当的治疗方法，以免影响胎儿的发育。如果对卵巢囊肿的处理有任何疑问，应及时与医生沟通，以便做出明智的决策。