月经结束第二天同房一般不会怀孕，但也不是绝对的。
排卵日一般在下次月经来潮前的14天左右，排卵日的前5天和后4天，连同排卵日在内共10天称为排卵期。除了月经期和排卵期，其他时间为安全期。在安全期同房，怀孕的几率比较小，但也有可能发生额外排卵，导致怀孕。因此，安全期避孕法并不可靠，失败率较高。
如果没有怀孕的计划，建议采取可靠的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药、宫内节育器等。同时，要注意性生活卫生，避免感染。如果出现月经推迟、恶心、呕吐等症状，应及时进行早孕检测，以确定是否怀孕。
总之，月经结束第二天同房怀孕的几率较小，但不能完全排除怀孕的可能。如果不想怀孕，建议采取可靠的避孕措施。如果出现月经异常，应及时就医，排除怀孕的可能。