睡一觉起来眼睛充血了，有如下几种可能：
1、最常见的是急性结膜炎，是细菌或者病毒感染引起的，症状有眼睛异物感、眼睛红、畏光、流泪、眼屎多。可以点左氧氟沙星眼药水，每天3-5次，更昔洛韦眼药水，每天4次，晚上睡觉前涂左氧氟沙星眼用凝胶。
2、过敏性结膜炎，是急性过敏引起的，可以有眼睛痒、眼睛充血，需要做过敏原检查，远离过敏原。可以短期应用激素类眼药水，如妥布霉素地塞米松眼药水，每天3-5次点眼。
3、严重的干眼症，泪膜是通过眼睑的瞬目运动，将泪液涂布在眼球表面，由于睡觉时瞬目少，睡醒后就可以出现眼睛充血，可以在睡觉前涂小牛血清去蛋白眼用凝胶。