怀孕三个月腰痛厉害可能是以下原因引起：
1.生理变化：怀孕后，随着子宫的增大，身体重心逐渐前移，为了保持平衡，孕妇的腰部肌肉和韧带会承受更多的压力，从而引起腰痛。
2.缺钙：怀孕后，孕妇对钙的需求量增加，如果摄入不足，会导致骨质疏松，引起腰痛。
3.过度劳累：怀孕后，孕妇的身体负担加重，如果过度劳累，会导致腰部肌肉疲劳，引起腰痛。
4.姿势不当：怀孕后，孕妇的腹部逐渐增大，为了保持身体平衡，孕妇可能会采取一些不正确的姿势，如弯腰、扭腰等，从而引起腰痛。
5.疾病因素：如果孕妇本身患有腰椎间盘突出、盆腔炎等疾病，怀孕后可能会加重病情，引起腰痛。
针对以上原因，可以采取以下措施缓解腰痛：
1.注意休息：避免过度劳累，尤其是长时间站立或坐着。睡觉时可以选择侧卧，在两腿之间和肚子下面垫一个枕头，以减轻腰部的压力。
2.补充钙质：多吃富含钙质的食物，如奶制品、豆制品、海鲜等，也可以在医生的指导下服用钙剂。
3.调整姿势：保持正确的姿势，避免弯腰、扭腰等动作。站立时，双脚分开与肩同宽，膝盖微微弯曲，不要长时间保持同一姿势。坐立时，腰部挺直，在腰部后面垫一个靠垫，以减轻腰部的压力。
4.适度运动：适当进行一些有氧运动，如散步、瑜伽等，可以增强腰部肌肉的力量，缓解腰痛。
5.热敷：用热水袋或热毛巾热敷腰部，每次20-30分钟，每天2-3次，可以缓解腰部肌肉的紧张和疼痛。
如果腰痛症状严重，或伴有阴道出血、腹痛等异常情况，应及时就医，排除先兆流产、早产等并发症的可能。同时，建议孕妇定期进行产前检查，及时发现和处理问题，确保自身和胎儿的健康。