半夜咳嗽的原因有多种，比如约40%的咳嗽变异性哮喘患者会在夜间或凌晨发作咳嗽。
呼吸系统疾病相关
鼻炎后滴漏：鼻腔炎症分泌的黏液会在夜间平躺时倒流至咽喉，刺激咳嗽感受器引发半夜咳嗽。如果鼻炎发作，鼻腔分泌物增多，这种情况更易出现。慢性支气管炎：该病患者气道存在慢性炎症，夜间迷走神经相对兴奋，气道反应性增高，加上夜间痰液积聚，容易导致半夜咳嗽。一般多见于长期吸烟的人群，病程较长。
心血管系统因素
左心衰竭：当左心衰竭时，夜间平卧使回心血量增加，肺淤血加重，从而引起半夜咳嗽，还可能伴有呼吸困难、咳粉红色泡沫痰等表现。多见于有基础心脏病史的人群，如高血压性心脏病、冠心病等患者。
环境因素影响
空气干燥：室内空气过于干燥时，会刺激呼吸道黏膜，导致半夜咳嗽。尤其是在秋冬季节，若室内没有加湿器，空气湿度低于40%时，这种情况较常见。过敏原刺激：床上用品如被褥、枕头等若长时间未清洁，可能滋生尘螨等过敏原，夜间接触后会引发呼吸道过敏反应，出现半夜咳嗽。据统计，约有30%的过敏性咳嗽与尘螨过敏有关。