嗓子疼半夜发烧，可能是由扁桃体炎、上呼吸道感染、流感等疾病引起的。
扁桃体炎是一种常见的上呼吸道感染性疾病，主要由乙型溶血性链球菌引起。其症状主要有咽痛、发热、吞咽困难等。此外，还可能伴有头痛、乏力、周身不适、食欲不振等全身症状。
上呼吸道感染是鼻腔、咽或喉部急性炎症的总称。其主要病原体是病毒，少数是细菌。主要表现为鼻塞、流涕、打喷嚏、咽痛、咳嗽、声音嘶哑等症状。部分患者可能会出现发热、头痛、全身不适、乏力等全身症状。
流感是由流感病毒引起的一种急性呼吸道传染病，其主要通过空气中的飞沫、人与人之间的接触或与被污染物品的接触传播。主要症状为发热、头痛、肌痛、乏力、食欲减退等全身症状，同时伴有咽痛、流涕、咳嗽等上呼吸道症状。
此外，嗓子疼半夜发烧还可能与其他疾病有关，如急性会厌炎、急性喉炎、疱疹性咽峡炎等。
如果出现嗓子疼半夜发烧的症状，建议及时就医，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意休息，多喝水，避免食用辛辣、刺激性食物。