直肠炎的用药需根据具体病因来选择，一般来说，常用的药物有氨基水杨酸制剂、糖皮质激素、免疫抑制剂等。比如对于轻中度溃疡性直肠炎，氨基水杨酸制剂中的柳氮磺吡啶较为常用，它能在肠道内分解出5-氨基水杨酸，发挥抗炎作用。
氨基水杨酸制剂类药物
柳氮磺吡啶： 适用于轻、中度直肠炎。它在肠道内分解为磺胺吡啶和5-氨基水杨酸，5-氨基水杨酸能抑制前列腺素合成，减轻炎症反应。美沙拉嗪： 也属于氨基水杨酸制剂，可用于直肠炎的治疗。它局部作用于肠道黏膜，抗炎效果较好，副作用相对柳氮磺吡啶可能稍小。
糖皮质激素药物
氢化可的松栓剂： 对于直肠炎局部炎症明显的情况，可使用氢化可的松栓剂直肠给药，能快速减轻直肠黏膜的炎症、水肿等症状。但长期使用可能会有一些副作用，如导致肠道菌群失调等。布地奈德灌肠剂： 布地奈德是一种局部作用的糖皮质激素，通过灌肠的方式作用于直肠部位，能有效缓解直肠炎引起的腹泻、腹痛等症状，全身副作用相对较小。
免疫抑制剂药物
硫唑嘌呤： 适用于对氨基水杨酸制剂疗效不佳或有激素依赖的直肠炎患者。它通过抑制免疫反应来发挥作用，但起效相对较慢，一般需要服用数月才能见到明显效果，而且可能会有骨髓抑制等副作用，用药期间需要定期监测血常规等指标。巯嘌呤： 与硫唑嘌呤作用机制类似，也可用于一些直肠炎的治疗，尤其是病情较为顽固的情况。同样存在可能影响骨髓造血功能等副作用，用药需谨慎。
对症治疗药物
止泻药： 如果直肠炎患者伴有腹泻症状，可适当使用止泻药，如蒙脱石散。蒙脱石散能吸附肠道内的毒素和病菌，保护肠道黏膜，起到止泻作用，但一般是在腹泻较严重时短期使用。益生菌： 直肠炎患者往往存在肠道菌群失调，可补充益生菌，如双歧杆菌四联活菌片。益生菌能调节肠道菌群平衡，促进肠道功能恢复，对直肠炎的康复有一定帮助。