扁桃体发炎时常用的药物有抗生素类等。一般细菌感染引起的扁桃体发炎，可选用青霉素类抗生素，如青霉素V钾片等，不过具体用药需根据病情来定。
抗生素类药物
青霉素类： 如果是细菌感染导致的扁桃体发炎，青霉素类药物是常用选择，像青霉素V钾片，它能抑制细菌细胞壁的合成，从而发挥杀菌作用。但要注意，对青霉素过敏的人不能用。头孢类： 头孢菌素类药物也常用于扁桃体发炎的治疗，比如头孢拉定胶囊。这类药物通过干扰细菌细胞壁的合成来杀菌，抗菌谱较广。不过，使用头孢类药物前也需要确认患者没有头孢类药物过敏史。
抗病毒药物
利巴韦林： 如果是病毒感染引起的扁桃体发炎，利巴韦林可能会用到。它能抑制病毒核酸的合成，起到抗病毒的作用。但利巴韦林有一定的副作用，使用时要遵医嘱。更昔洛韦： 对于一些较为严重的病毒感染导致的扁桃体发炎，可能会用到更昔洛韦。它也是通过抑制病毒DNA合成来发挥抗病毒功效，但使用时需密切关注不良反应。
对症治疗药物
解热镇痛药： 当扁桃体发炎伴有发热、咽痛时，可使用解热镇痛药，如对乙酰氨基酚片。它能通过抑制前列腺素的合成，达到解热镇痛的效果。不过，有严重肝肾功能不全的人要慎用。含漱液： 局部使用含漱液也能缓解扁桃体发炎的症状，比如复方硼砂含漱液。用它含漱可以清洁口腔、杀菌消炎，减轻咽部不适。使用含漱液时要按照正确的方法，充分含漱后吐出。