三九感冒灵颗粒和感冒清热颗粒的区别主要体现在以下几个方面：
1.成分不同
三九感冒灵颗粒主要成分有三叉苦、岗梅、金盏银盘、薄荷油、野菊花、马来酸氯苯那敏、咖啡因、对乙酰氨基酚。感冒清热颗粒主要成分有荆芥穗、薄荷、防风、柴胡、紫苏叶、葛根、桔梗、苦杏仁、白芷、苦地丁、芦根。
2.功效不同
三九感冒灵颗粒解热镇痛。用于感冒引起的头痛，发热，鼻塞，流涕，咽痛。感冒清热颗粒疏风散寒，解表清热。用于风寒感冒，头痛发热，恶寒身痛，鼻流清涕，咳嗽咽干。
3.适用人群不同
三九感冒灵颗粒适用于风热感冒，发热重，恶寒轻，有汗，口渴，鼻流浊涕，咽喉红肿疼痛，咳吐黄痰。感冒清热颗粒适用于风寒感冒，恶寒重，发热轻，无汗，头痛身痛，鼻塞流清涕，咳嗽吐稀白痰。
4.不良反应不同
三九感冒灵颗粒偶见皮疹、荨麻疹、药热及粒细胞减少；可见困倦、嗜睡、口渴、虚弱感；长期大量用药会导致肝肾功能异常。感冒清热颗粒尚不明确。
5.注意事项不同
三九感冒灵颗粒忌烟、酒及辛辣、生冷、油腻食物。不宜在服药期间同时服用滋补性中药。高血压、心脏病、肝病、肾病等慢性病严重者应在医师指导下服用。儿童、年老体弱者、孕妇应在医师指导下服用。对本品过敏者禁用，过敏体质者慎用。本品含对乙酰氨基酚、马来酸氯苯那敏。服用本品期间不得饮酒或含有酒精的饮料；不能同时服用与本品成份相似的其他抗感冒药；肝、肾功能不全者慎用；膀胱颈梗阻、甲状腺功能亢进、青光眼、高血压和前列腺肥大者慎用；孕妇及哺乳期妇女慎用；服药期间不得驾驶机、车、船、从事高空作业、机械作业及操作精密仪器。
感冒清热颗粒忌烟、酒及辛辣、生冷、油腻食物。不宜在服药期间同时服用滋补性中药。糖尿病患者及有高血压、心脏病、肝病、肾病等慢性病严重者应在医师指导下服用。儿童、孕妇、哺乳期妇女、年老体弱者应在医师指导下服用。发热体温超过38.5℃的患者，应去医院就诊。服药3天症状无缓解，应去医院就诊。对本品过敏者禁用，过敏体质者慎用。本品性状发生改变时禁止使用。儿童必须在成人监护下使用。请将本品放在儿童不能接触的地方。如正在使用其他药品，使用本品前请咨询医师或药师。
总之，三九感冒灵颗粒和感冒清热颗粒虽然都可用于治疗感冒，但在成分、功效、适用人群、不良反应、注意事项等方面均有所不同。因此，在使用时应根据自身症状选择合适的药物，并严格按照说明书或医生的建议使用。同时，应注意休息、多喝水、保持室内空气流通，以促进病情的恢复。如果症状持续不缓解或加重，应及时就医。