后半夜上腹部中间疼痛可能由多种原因引起，其中消化性溃疡较为常见，比如十二指肠溃疡，约有2/3的患者疼痛呈节律性，空腹时疼痛明显，后半夜处于空腹状态，容易引发上腹部中间疼痛。
消化性溃疡导致的疼痛特点
十二指肠溃疡： 典型表现为空腹疼痛，后半夜时胃内食物已基本排空，胃酸直接刺激溃疡面，从而引起上腹部中间疼痛，疼痛还可能在进食后缓解，一般疼痛有一定规律性，可持续数周或数月后缓解，间隔一段时间又复发。胃溃疡： 疼痛多在进食后1小时内出现，经1 - 2小时后缓解，不过也有少部分胃溃疡患者可能在后半夜出现疼痛，疼痛性质多样，可为钝痛、胀痛、灼痛等。
胆囊方面的原因
胆囊炎： 胆囊位于右上腹，但有时疼痛可能会放射到上腹部中间。后半夜人体迷走神经兴奋，可能会刺激胆囊收缩，若胆囊有炎症，就容易引发疼痛，尤其是在进食高脂饮食后更容易诱发，胆囊炎发作时除了上腹部中间疼痛，还可能伴有恶心、呕吐等症状。胆结石： 结石移动时可能会刺激胆囊或胆管，后半夜身体处于相对静止状态，结石活动刺激周围组织也可能导致上腹部中间疼痛，疼痛程度可轻可重，严重时会较为剧烈，还可能伴有黄疸、发热等表现。
胃部其他问题
胃炎： 各种原因引起的胃炎，如幽门螺杆菌感染导致的胃炎，胃黏膜处于受损状态，后半夜胃酸分泌相对活跃，会刺激胃黏膜，引起上腹部中间疼痛，同时可能伴有腹胀、嗳气、食欲不振等症状，胃炎的发生与长期饮食不规律、大量饮酒等因素有关。胃痉挛： 后半夜腹部着凉、饮食刺激等都可能引起胃痉挛，导致上腹部中间突然出现疼痛，疼痛较为剧烈，呈阵发性，通过保暖、喝温水等可能会有所缓解，但如果频繁发作胃痉挛，就需要进一步排查原因。