月经干净后二天同房出血，可能是以下原因引起：
1.子宫内膜尚未修复：月经刚结束时，子宫内膜还未完全修复，此时同房可能导致尚未修复的子宫内膜再次破裂，引起出血。
2.阴道炎或宫颈炎：患有阴道炎或宫颈炎时，同房可能刺激炎症部位，导致出血。
3.宫颈息肉：宫颈息肉是宫颈黏膜的增生性病变，质地脆弱，容易在同房时出血。
4.子宫内膜异位症：子宫内膜异位症可能导致子宫肌层或其他部位的组织生长在子宫外，同房时可能引起出血。
5.其他：宫颈癌、黏膜下子宫肌瘤等疾病也可能导致同房后出血。
如果出现月经干净后二天同房出血的情况，建议及时就医，进行详细的检查，如妇科检查、B超等，以确定出血的原因，并采取相应的治疗措施。同时，在治疗期间应避免同房，注意个人卫生，保持外阴清洁。
需要注意的是，以上内容仅供参考，具体情况请以医生的诊断为准。