偏头疼眼睛疼可能是多种原因导致的。比如，有研究发现，约有1/3的偏头痛患者在头痛发作时会伴随眼睛疼痛的症状。
神经血管因素导致
血管收缩扩张影响： 偏头痛发作时，头部的血管会出现收缩和扩张的异常变化。当血管变化波及到眼部周围的血管时，就可能引起眼睛疼。例如，颅内血管的舒缩功能紊乱，会影响到眼部相关神经的供血和神经传导，从而导致眼睛部位出现疼痛不适。神经传导牵涉： 头部的神经和眼部的神经有一定关联。偏头痛发作时，神经传导通路出现异常，可能会牵涉到眼部神经，引发眼睛疼。比如三叉神经等头部神经的异常放电或传导异常，会传递到眼部相关区域，引起眼睛部位的疼痛感觉。
眼部肌肉因素相关
肌肉紧张痉挛： 在偏头痛发作过程中，患者往往会伴随头部肌肉的紧张，这种紧张可能会波及到眼部周围的肌肉。眼部肌肉紧张痉挛时，就会引起眼睛疼。比如眼轮匝肌等眼部周围肌肉紧张，会导致眼部有紧绷、疼痛的感觉。眼部调节功能紊乱： 偏头痛可能影响到眼部的调节功能，使得眼睛的晶状体等结构调节异常，进而引发眼睛疼。例如，眼睛在看东西时，调节功能出现问题，就会产生眼部的不适疼痛。
炎症反应相关因素
局部炎症参与： 偏头痛发作时，身体可能会出现一些炎症反应相关变化。如果眼部周围组织受到炎症反应的影响，也可能导致眼睛疼。比如眼部的血管周围可能会有轻度的炎症细胞浸润等情况，刺激周围神经引起疼痛。炎性介质释放： 偏头痛发作时，体内会释放一些炎性介质，这些炎性介质如果影响到眼部组织，也会导致眼睛疼。例如前列腺素等炎性介质的释放，可能会作用于眼部的神经末梢，引发疼痛感觉。