月经干净后第二天同房有怀孕的可能，但相对较低。一般月经周期规律的女性，排卵日通常在下次月经前14天左右，排卵日前后4-5天为易孕期，其余时间为安全期。月经干净后第二天，若月经周期为28-30天，此时可能还未到排卵期，怀孕几率相对小，但不是绝对不会怀孕，因为有些女性排卵会受环境、情绪等因素影响提前或推迟。
月经周期与排卵期的关系
月经周期规则者：对于月经周期固定为28天的女性，月经持续3-7天，那么月经干净后第二天大概处于月经周期的第7天左右，这时候距离排卵期（第14天左右）还有一段时间，卵子排出的可能性较低，怀孕概率相对小。但如果月经周期较短，比如22天左右，月经持续5天，那月经干净后第二天可能就接近排卵期了，怀孕几率会增加。月经周期不规则者：有些女性月经周期不规律，就很难通过月经干净时间来准确判断是否处于安全期。这类女性排卵时间不固定，月经干净后第二天也有可能刚好赶上排卵，从而增加怀孕风险。
怀孕的必要条件
精子与卵子结合：怀孕需要精子进入女性体内与卵子结合形成受精卵。精子在女性生殖道内可存活2-3天，卵子排出后可存活1-2天。如果在月经干净后第二天同房，精子进入体内，而如果之后女性提前排卵，就有可能让精子和卵子相遇结合。输卵管通畅：输卵管是输送卵子和受精卵的通道，要是输卵管不通畅，即便有精子和卵子也无法结合形成受精卵，也就不会怀孕。所以输卵管是否通畅也会影响怀孕情况。
避孕的可靠性分析
安全期避孕不可靠：不能单纯依靠月经干净后第二天是安全期就不采取避孕措施，因为安全期避孕失败率较高，大概在20%左右。相比之下，使用安全套、口服短效避孕药等避孕方法可靠性更高。安全套正确使用的话，避孕成功率能达到95%以上；口服短效避孕药按时服用，避孕有效率也能达99%左右。所以不建议把月经干净后第二天同房当作安全期来避免怀孕，最好采取可靠的避孕措施。