月经干净后第二天同房，怀孕的可能性相对较低，但不是绝对不会怀孕。一般来说，月经周期规律的女性，排卵期通常在下次月经前14天左右，月经干净后第二天相对处于相对安全期，但也有女性排卵不规律，还是有意外怀孕的可能，不过概率较低，大概在5% - 10%左右。
月经周期与排卵的关系
月经周期规律的情况： 对于月经周期比较规律，比如28 - 30天左右的女性，月经持续时间一般3 - 7天，那么月经干净后第二天处于卵泡早期，这个时候卵泡还没有发育成熟，通常不会排卵，所以怀孕几率较低。但如果月经周期较短，比如21天左右，月经持续5天，那么月经干净后第二天可能已经接近排卵期，就有怀孕的可能。排卵不规律的情况： 有些女性因为生活环境改变、情绪波动等因素，排卵会不规律，可能会出现意外排卵的情况。比如原本预计的安全期，突然因为内分泌失调等原因提前排卵，那么在月经干净后第二天同房就有怀孕的风险。
怀孕的必要条件
精子和卵子结合： 怀孕需要女方排出正常的卵子，男方有正常的精子，并且精子和卵子能够在输卵管内相遇结合形成受精卵，然后受精卵着床在子宫腔内。在月经干净后第二天，如果女性没有排卵，就缺少了卵子这个必要条件，怀孕就不太可能发生。但如果有意外排卵，精子进入女性体内与卵子结合，就会怀孕。生殖系统正常： 女性的输卵管要通常，这样才能让精子和卵子相遇；子宫内环境要适合受精卵着床等。如果生殖系统有问题，即使在所谓的安全期同房，也可能影响怀孕，但从概率上来说，月经干净后第二天正常情况下怀孕概率低。
采取避孕措施的重要性
使用安全套： 如果不想意外怀孕，即使在所谓的安全期，也可以考虑使用安全套避孕。安全套不仅可以降低怀孕的风险，还能预防性传播疾病。口服短效避孕药： 对于月经规律的女性，也可以在医生指导下服用短效避孕药，通过调节激素水平来抑制排卵，达到避孕的目的，但服用短效避孕药需要按照规律服用，不能漏服。