吃益生菌还拉稀可能有多种原因。一般来说，吃益生菌后仍拉稀可能是以下情况导致：
益生菌本身的因素
菌株不匹配：不同的益生菌菌株针对的肠道问题有所不同。比如有些菌株主要针对便秘，而如果选择了针对便秘的菌株来改善腹泻问题，可能就难以起效。目前已发现的益生菌菌株有上百种，不同菌株的功能差异较大。活菌数量不足：如果益生菌产品中活菌数量过低，比如低于一定阈值（一般认为要达到有效剂量，像有的产品要求每克至少含有10亿个活菌），那么进入肠道后能发挥调节作用的活菌数量就很少，无法很好地调节肠道菌群，也就可能出现吃了还是拉稀的情况。
个体肠道状况差异
肠道损伤严重：当肠道受到比较严重的损伤时，比如患有较为严重的肠炎，肠道黏膜有较多破损，仅仅依靠益生菌来调节可能不够。例如一些重症肠炎患者，肠道的消化吸收和屏障功能都受到明显破坏，这时候单纯吃益生菌往往不能快速止住拉稀。一般重症肠炎可能需要住院治疗，通过药物等多种手段综合干预。肠道菌群失衡过度：有些人群肠道菌群失衡非常严重，比如长期大量使用抗生素后，肠道菌群紊乱到了比较极端的程度，单一的益生菌补充可能无法在短时间内让肠道菌群恢复到正常状态来控制腹泻。通常长期大量使用抗生素后，肠道菌群的恢复可能需要数周甚至更长时间来调整。
外部因素影响
饮食不当：在吃益生菌期间，如果仍然大量进食辛辣、油腻、刺激性食物，或者暴饮暴食，就会影响益生菌的作用。比如吃了大量油腻食物后，肠道的消化负担加重，即使补充了益生菌，也可能无法很好地调节肠道功能来止住拉稀。一般建议在吃益生菌期间，保持清淡、规律的饮食，每天三餐定时定量，避免食用过多刺激性食物。环境变化：突然改变生活环境，比如从熟悉的地方到气候、环境差异较大的地方，也可能影响肠道功能导致拉稀。例如从温暖湿润的地区到干燥寒冷的地区，人体肠道需要一定时间适应新环境，这时候吃益生菌可能还没完全发挥作用就会出现拉稀情况。一般适应新环境可能需要1 - 2周的时间来调整肠道功能。