肛瘘是指肛管或直肠与肛周皮肤相通的肉芽肿性管道，主要症状有以下几种：
1.肛门周围脓肿：是肛瘘的初期症状，一般会逐渐加重，表现为肛周持续性跳动性疼痛，行走不便，坐卧不安，全身感染症状不明显。
2.局部流脓：是肛瘘的主要症状，脓液多少与瘘管长短和多少有关，新生瘘管流脓较多，分泌物刺激皮肤而瘙痒不适，有时形成湿疹。当外口阻塞或假性愈合时，瘘管内脓液积存，局部肿胀疼痛，甚至发热，以后封闭的瘘口破溃，症状方始消失。
3.瘘管瘙痒：由于脓液不断刺激肛周皮肤，常感觉瘙痒，肛周潮湿不适，皮肤变色、表皮脱落，纤维组织增生和增厚，有时形成湿疹。
4.排便不畅：复杂性肛瘘口久不愈，可引起肛门直肠周围形成大的纤维化瘢痕或环状的条索，影响肛门的舒张和闭合，大便时感到困难，有便意不尽的感觉。
5.全身症状：在急性炎症期和复杂性肛瘘反复发作时，可出现不同程度的发热、或伴有消瘦、贫血、体虚等长期慢性消耗症状。