扁桃体发炎和咽炎是两种不同的疾病，它们的区别如下：
1.病因不同：扁桃体炎是由细菌或病毒感染引起的，常见的细菌有乙型溶血性链球菌、肺炎链球菌等，常见的病毒有鼻病毒、流感病毒等；咽炎可由细菌感染、病毒感染、环境刺激、过敏等因素引起。
2.症状不同：扁桃体炎主要表现为咽痛、吞咽困难、发热等症状，有时还会伴有头痛、乏力等全身症状；咽炎主要表现为咽部不适、干燥、瘙痒、疼痛等症状，有时会出现刺激性咳嗽。
3.部位不同：扁桃体位于口咽部，是一对形似扁桃的淋巴组织；咽炎则可分为急性咽炎和慢性咽炎，急性咽炎主要发生在咽部黏膜及黏膜下组织，慢性咽炎则主要发生在咽部黏膜、黏膜下及淋巴组织。
4.治疗方法不同：扁桃体炎的治疗主要包括使用抗生素（如青霉素、头孢菌素等）、抗病毒药物（如利巴韦林等）、解热镇痛药（如对乙酰氨基酚等）等进行治疗，必要时可进行手术治疗；咽炎的治疗主要包括使用含片（如西瓜霜含片、草珊瑚含片等）、漱口水（如复方硼砂溶液等）、雾化吸入（如布地奈德混悬液等）等进行治疗，同时应注意休息、多饮水、保持口腔清洁等。
需要注意的是，扁桃体发炎和咽炎有时可能同时存在，也可能相互转化。在治疗过程中，应根据具体情况选择合适的治疗方法，并注意休息、多饮水、保持口腔清洁等。如果症状持续不缓解或加重，应及时就医。