上颌窦囊肿手术通常是在全身麻醉下进行的，因此整个手术过程患者不会感到痛苦。但在手术前需要进行局部麻醉和注射药物，可能会有一些疼痛和不适。此外，手术后患者可能会感到面部肿胀、疼痛和鼻塞等不适，但这些症状通常会在几天到几周内逐渐缓解。
需要注意的是，对于一些特殊人群，如儿童、老年人或患有其他疾病的患者，手术的风险和疼痛可能会有所不同。因此，在手术前，医生会对患者进行全面的评估，并根据患者的具体情况制定个性化的手术方案和麻醉方案。
此外，手术后患者需要注意休息和饮食，避免剧烈运动和用力擤鼻等行为，以促进恢复。如果患者在手术后出现严重的疼痛、出血或其他不适症状，应及时就医。
总之，上颌窦囊肿手术通常是一种安全有效的治疗方法，但在手术前和手术后，患者需要密切配合医生的治疗，以确保手术的成功和恢复。