上颌窦囊肿手术一般在全麻下进行，通常是在鼻腔内做一个小切口，然后通过这个切口将囊肿切除。手术过程中患者不会感到疼痛，因为会进行麻醉。但是手术后，患者可能会感到一些疼痛和不适，这是正常的术后反应。
手术后的疼痛程度因人而异，有些人可能会感到比较疼痛，需要使用止痛药来缓解疼痛。一般来说，医生会在手术后给患者开一些止痛药，患者按照医生的建议服用即可。此外，患者还需要注意休息，避免剧烈运动和劳累，保持鼻腔清洁，避免感染。
需要注意的是，上颌窦囊肿手术是一种比较常见的手术，手术风险较小，但也存在一定的风险。在手术前，患者需要进行全面的检查和评估，确保身体状况适合手术。手术后，患者需要按照医生的建议进行护理和恢复，如有任何不适或异常情况，应及时就医。