纳豆激酶具有一定的溶解血栓作用，研究发现，一般口服纳豆激酶后，在一定时间内可能会对血液的纤溶系统产生影响。不过，它的功效并非万能的。
对血液纤溶系统的影响
促进纤溶酶原激活：纳豆激酶能够激活纤溶酶原，使其转化为有活性的纤溶酶，而纤溶酶可以分解血栓中的纤维蛋白，从而起到一定的溶解血栓效果。有研究表明，适量摄入含纳豆激酶的产品后，能在一定程度上改变血液中与纤溶相关指标。降低血液黏稠度：通过其对血栓的作用，间接有助于降低血液黏稠度，使血液流动更加顺畅。一般来说，持续一段时间摄入含有纳豆激酶的合适产品，可能会观察到血液黏稠度有一定程度的改善迹象。
对心血管方面的潜在益处
改善血管功能：纳豆激酶可能对血管内皮细胞有一定保护作用，有助于维持血管的正常弹性和舒张功能。一些小型研究发现，长期食用纳豆相关制品（含纳豆激酶）的人群，其血管内皮功能相关指标相对较好。辅助调节血脂：有研究显示，纳豆激酶可能对血脂代谢有一定影响，有助于降低血液中低密度脂蛋白胆固醇等不良血脂成分的水平，但这一作用相对较为温和，不能替代正规的降脂药物治疗。
对其他方面的可能作用
缓解疲劳：有初步研究推测，纳豆激酶通过改善血液循环，可能有助于缓解身体因血液循环不畅导致的疲劳感。不过这方面还需要更多大规模、严谨的研究来进一步证实。对肠道健康的潜在影响：纳豆激酶本身主要作用于血液系统，但纳豆在发酵过程中产生的一些其他成分可能对肠道菌群等有一定调节作用，不过这与纳豆激酶本身的直接关联还需明确区分研究。但需要注意的是，纳豆激酶不能替代正规的医疗治疗手段，如果有相关疾病问题，还是要以正规的医疗诊断和治疗为主，不能单纯依赖纳豆激酶来解决严重的健康问题。比如对于已经确诊有严重血栓性疾病的患者，不能仅靠纳豆激酶来治疗，必须遵循医生的正规治疗方案。