头痛的病理生理基础是可以由炎症的因素引起，也可以由颅内压升高的因素引起。常见的颅内压升高因素有病毒性脑炎、化脓性脑炎、结核性脑炎;小灶脑出血或者脑血栓的形成，不伴有肢体活动功能障碍。
发热是人体对病毒和细菌有效的应激状态反应，当外敌入侵人体机体的时候，体内的吞噬细胞就会吞噬病毒和细菌，释放出致热物质，表现出体温升高、发热的状态。
头痛发热见于以下疾病:各种类型的脑炎;上呼吸道感染合并有小灶的脑出血或者脑血栓，此类患者不具有肢体活动功能障碍，临床上容易漏诊，单纯的上呼吸道感染，头痛是由炎症导致的症状性头痛。