支原体感染后，不同人群表现的症状有所差异。一般来说，支原体感染后潜伏期通常为2~3周。
儿童支原体感染症状
呼吸道症状为主： 儿童感染支原体后，最常见的是咳嗽，多为刺激性干咳，有的孩子咳嗽较为剧烈，可能会持续较长时间，有时还会伴有发热，体温可高达39℃左右，但发热持续时间个体差异较大，有的孩子发热3~5天，有的可能会持续1~2周。部分儿童还可能出现头痛、咽痛、肌肉酸痛等症状。
成年人支原体感染症状
呼吸道症状明显： 成年人感染支原体后，呼吸道症状较为突出，咳嗽是主要表现，可为干咳或伴有少量黏痰，咳嗽可持续数周甚至数月。同时可能伴有发热，体温一般在38℃左右，也有部分人发热体温较高。另外，还可能出现乏力、食欲减退、咽喉疼痛等症状。
免疫力低下人群支原体感染症状
症状相对较重且多样： 免疫力低下的人群，如患有基础疾病、长期使用免疫抑制剂等的人感染支原体后，除了呼吸道的明显咳嗽、发热等症状外，可能更容易引发下呼吸道感染，出现气促、呼吸困难等表现，病情发展可能较快，还可能伴有更明显的全身不适，如极度乏力、精神萎靡等，而且恢复相对较慢。
泌尿生殖系统支原体感染症状
男性泌尿生殖系统： 男性感染泌尿生殖系统支原体后，可能出现尿道刺痛、瘙痒，伴有不同程度的尿频、尿急，尿道口可能有轻度红肿，分泌物稀薄。女性泌尿生殖系统： 女性感染后可能出现白带增多，呈黏液脓性，外阴瘙痒，尿道灼热感等，有的还可能出现月经紊乱等情况。