跑完步后一侧腰部不舒服，可能与以下原因有关。
1.运动过度或姿势不当：如果跑步时运动量过大、强度过高，或跑步姿势不正确，可能导致腰部肌肉疲劳、拉伤或扭伤，从而引起疼痛。
2.腰椎间盘突出：腰椎间盘突出症患者在跑步时，可能因腰部活动导致椎间盘受到挤压，刺激神经根，引起一侧腰部疼痛。
3.肾脏疾病：如肾结石、肾炎等，也可能导致跑步后一侧腰部疼痛。
4.其他原因：女性在生理期或排卵期，也可能出现一侧腰部不适。此外，脊柱侧弯、强直性脊柱炎等疾病也可能引起腰部疼痛。
如果跑完步后一侧腰部不舒服的症状持续不缓解或加重，建议及时就医，进行详细的检查，如腰椎X光、CT、MRI等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。
在日常生活中，跑步前应做好热身运动，跑步时要保持正确的姿势，控制好运动量和强度。如果在跑步过程中出现腰部不适，应立即停止运动，休息观察。此外，还应注意腰部保暖，避免长时间弯腰或久坐。