附件囊肿是妇科常见疾病，目前并没有特定的药物能保证一定消除附件囊肿。对于生理性的附件囊肿，部分可自行消失，一般无需特殊用药；对于病理性附件囊肿，需根据具体情况处理。
一、生理性附件囊肿
成因及特点：生理性附件囊肿多与月经周期有关，如卵泡囊肿、黄体囊肿等，一般直径小于5厘米，可随月经周期变化自行消失，通常不需要药物治疗，但要定期复查超声观察囊肿变化。
二、病理性附件囊肿
炎症性附件囊肿：如果是由炎症引起的附件囊肿，可能会使用抗生素治疗，如头孢类抗生素等，但抗生素主要是针对炎症，不一定能直接使囊肿消失，而是通过控制炎症来避免囊肿进一步增大等情况，不过这需要医生根据具体的炎症情况来判断是否使用及使用何种抗生素。
子宫内膜异位症导致的附件囊肿（巧克力囊肿）：可能会使用孕激素类药物，如甲地孕酮等，这类药物可以抑制子宫内膜的活性，从而控制子宫内膜异位症的发展，在一定程度上可能会使巧克力囊肿缩小，但也不能保证囊肿完全消失，而且药物使用需要在医生严格指导下进行，因为不同患者情况不同。
特殊人群方面，孕妇发现附件囊肿需谨慎用药，因为很多药物可能会对胎儿产生影响，一般以观察为主，根据囊肿情况再做进一步处理；哺乳期女性用药也需要考虑药物是否会通过乳汁影响婴儿，所以用药更要谨慎，需在医生评估利弊后决定；对于有肝肾功能不全的患者，使用药物时要特别注意，因为药物需要通过肝肾功能代谢，可能需要调整药物剂量或选择对肝肾功能影响小的药物，并且要密切监测肝肾功能指标。