大脚趾甲凹凸不平，可能是以下原因引起：
1.灰指甲：由皮肤癣菌、酵母菌及非皮肤癣菌等真菌引起。甲板被真菌感染后，甲板会出现浑浊、增厚、变色、萎缩、脱落、翘起、凹凸不平等现象。可通过真菌镜检、培养等明确诊断。治疗上以外用药物为主，如阿莫罗芬乳膏、环吡酮胺乳膏等，病情严重时需口服药物，如伊曲康唑胶囊、特比萘芬片等。
2.甲营养不良：可能与维生素、微量元素缺乏，银屑病，扁平苔藓，甲外伤等有关。这种情况甲板会变薄、变软、易碎，颜色呈灰色或黄色，表面也会变得凹凸不平。可通过微量元素检测等明确诊断。治疗上主要是补充维生素和微量元素，平时可多吃一些富含维生素和微量元素的食物，如胡萝卜、西红柿、动物肝脏等。
3.扁平苔藓：病因尚不清楚，可能与内分泌因素、精神因素、感染因素、免疫因素等有关。甲板会出现纵行的白色条纹，甲板远端会增厚，质地变得疏松，容易脱落，形成沟纹，从而导致大脚趾甲凹凸不平。可通过皮肤镜、病理活检等明确诊断。扁平苔藓目前尚无特效疗法，一般以内服药物为主，如糖皮质激素、免疫抑制剂等，同时可配合外用药物，如他克莫司软膏、吡美莫司乳膏等。
4.银屑病：俗称牛皮癣，病因尚不清楚，可能与遗传、感染、免疫、内分泌、环境等因素有关。甲板会出现点状凹陷，甲板失去光泽，增厚或变薄，易碎，颜色呈黄色或棕色，表面也会变得凹凸不平。可通过皮肤镜、病理活检等明确诊断。银屑病目前无法根治，主要通过外用药物、口服药物、物理治疗等方法来缓解症状，控制病情。常用的药物有糖皮质激素、维生素D3衍生物、免疫抑制剂等。
5.甲下肿瘤：如甲下黑色素瘤、甲下内生软骨瘤等，也会导致大脚趾甲凹凸不平。这种情况通常还会伴有其他症状，如疼痛、出血、变色等。需要及时就医，通过病理活检等方法明确诊断，并进行相应的治疗。
总之，大脚趾甲凹凸不平的原因很多，如果长期不愈或伴有其他症状，建议及时就医，明确诊断，以免延误病情。