呼吸麻醉在合理规范应用下相对安全，但也可能存在一些潜在危害。一般来说，呼吸麻醉的危害发生率相对较低，但仍需关注。
对呼吸系统的影响
呼吸抑制风险： 在麻醉诱导、维持过程中，可能出现不同程度的呼吸抑制，尤其是对于一些呼吸功能本身较弱的患者，比如老年患者或者存在慢性阻塞性肺疾病的患者，可能会导致呼吸频率减慢、潮气量降低，严重时可能需要辅助呼吸来维持正常的气体交换。气道相关问题： 插管过程中可能会对气道造成一定的机械性损伤，比如咽喉部黏膜的擦伤等；另外，也有发生喉头水肿的可能，虽然发生率不高，但一旦出现会影响气道通畅，严重时需要紧急处理。
对循环系统的影响
血压波动： 麻醉药物可能会引起血管扩张，导致血压下降，尤其是快速诱导麻醉时，部分患者可能出现明显的血压降低，需要及时采取措施维持血压稳定。而在麻醉苏醒期，也可能出现血压反跳升高的情况，对于有高血压病史且血压控制不佳的患者，这种波动可能会带来不良影响。心率变化： 呼吸麻醉药物可能影响心脏的节律和传导，导致心率减慢或者心律失常等情况，不过大多数是短暂的、可逆的，但对于本身存在心脏基础疾病的患者，如冠心病、心律失常患者，可能会加重病情。
对神经系统的影响
苏醒期认知功能障碍： 尤其是对于老年患者，在术后可能会出现短暂的苏醒期认知功能障碍，表现为记忆力减退、注意力不集中等，但一般多数在数周内会逐渐恢复。不过也有研究发现，对于一些特殊人群，如长期接受手术的老年患者，这种认知功能障碍的发生风险可能会有所增加。神经损伤风险： 在麻醉操作过程中，虽然发生神经损伤的概率较低，但仍有极小的可能出现外周神经损伤，比如臂丛神经损伤等，不过随着麻醉操作技术的不断提高，这种风险已经大大降低。
其他潜在危害
药物过敏反应： 虽然发生概率较低，但存在对麻醉药物过敏的可能，轻者表现为皮疹、瘙痒等，重者可能出现过敏性休克，危及生命。术后恶心呕吐： 部分患者在呼吸麻醉后可能会出现术后恶心呕吐的情况，尤其是一些有胃肠道手术史或者对麻醉药物敏感的患者，这不仅会增加患者的不适，还可能影响患者的恢复和营养摄入。