人流后第六天小腹阵痛可能由多种原因引起，一般来说，可能与子宫收缩、宫腔残留、感染等因素有关。
子宫收缩因素
子宫复旧引起：人流后子宫需要收缩恢复到孕前状态，在收缩过程中可能会出现小腹阵痛，这种情况比较常见，一般疼痛程度较轻，多在可忍受范围内，通常会持续数天。比如大部分女性在人流后1 - 2周内可能会有子宫收缩引起的轻微腹痛。宫缩强度影响：如果子宫收缩较好，可能阵痛相对规律且程度不重；但如果子宫收缩欠佳，阵痛可能会相对明显些。
宫腔残留因素
残留组织刺激：如果人流后宫腔内有妊娠组织残留，残留的组织会刺激子宫，引起子宫收缩，从而导致小腹阵痛。这种疼痛可能相对较剧烈，而且可能会伴有阴道流血量增多等情况。一般在人流后阴道流血时间超过10天以上，同时伴有腹痛，就要高度怀疑有宫腔残留的可能。残留大小差异：如果残留组织较少，可能阵痛相对较轻；但如果残留组织较多，子宫收缩难以将其排出，腹痛可能会持续存在且逐渐加重。
感染因素
术后感染引发：人流后如果不注意个人卫生，或者过早同房等，可能会引起宫腔感染。感染会导致子宫内膜发炎，进而引起小腹阵痛，同时还可能伴有阴道分泌物增多、有异味，甚至发热等症状。一般感染引起的腹痛多为持续性，而且可能会逐渐加重。比如术后体温如果超过38℃，同时伴有小腹明显疼痛，就要考虑感染的可能。感染程度不同：轻度感染可能腹痛相对较轻，仅有下腹隐痛；但重度感染时，腹痛会比较剧烈，还可能伴有全身不适等症状。