健康证一般不需要检查肛门。
健康证是指预防性健康检查证明，证明受检者具备做从业规定的健康素质。健康证的办理一般在当地的疾病预防控制中心或经卫生行政部门审批承担预防性健康检查的医疗卫生机构，不同的地区可能会有不同的要求，但通常包括以下项目：
1.一般检查：包括身高、体重、血压、心肺听诊等。
2.内科检查：包括心肺、肝脾、腹部等。
3.外科检查：包括皮肤、淋巴结、甲状腺、脊柱四肢等。
4.实验室检查：包括血常规、尿常规、肝功能、肾功能、血糖、血脂、乙肝五项等。
5.影像学检查：包括X线、B超、心电图等。
6.其他检查：根据不同的行业和地区，可能还需要检查其他项目，如食品从业人员需要检查肠道致病菌等。
肛门检查通常不是健康证的必检项目，只有在从事食品、饮用水生产经营人员，直接从事化妆品生产的人员，公共场所直接为顾客服务的人员，有害作业人员，放射工作人员以及在校学生等特殊职业人群时，才需要进行肛检，以检查是否有伤寒、痢疾、病毒性肝炎等消化道传染病。
需要注意的是，具体的检查项目和要求可能因地区、行业和具体情况而有所不同。在办理健康证前，最好先了解当地的相关规定和要求，并按照要求进行准备。同时，在检查过程中，应如实告知医生自己的健康状况和病史，以便医生做出准确的诊断和评估。