咽喉有小肉疙瘩可能是以下原因所致：
1.咽喉部淋巴滤泡增生：通常是由于咽部反复受到刺激，如长期吸烟、饮酒、过度用嗓等，导致咽部黏膜及黏膜下组织出现炎症反应，从而引起淋巴滤泡增生。患者可无明显症状，也可伴有咽部异物感、咽干、咽痒等症状。
2.扁桃体肥大：扁桃体肥大是一种常见的咽部疾病，可由扁桃体炎反复发作、扁桃体隐窝引流不畅等原因引起。扁桃体肥大可导致咽部狭窄，出现呼吸不畅、打鼾等症状，也可在扁桃体表面看到小肉疙瘩。
3.乳头状瘤：乳头状瘤是一种良性肿瘤，可发生于咽喉部的任何部位，常见于声带、室带等部位。乳头状瘤通常呈乳头状或菜花状，表面不光滑，质地较硬。
4.其他：咽喉部的良恶性肿瘤、咽旁间隙肿瘤等也可导致咽喉部出现小肉疙瘩。
如果发现咽喉部有小肉疙瘩，建议及时就医，进行详细的检查，如喉镜、血常规等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。在治疗期间，患者应注意休息，避免过度用嗓，保持口腔清洁，避免食用辛辣、刺激性食物。