同房第二天有棕色分泌物可能是以下原因导致的：
1.宫颈炎：如果女性本身就有宫颈炎，在同房时会导致宫颈受到刺激，引起少量出血，血液在阴道内残留时间较长，就会出现棕色分泌物。
2.子宫内膜炎：子宫内膜炎会导致子宫内膜充血、水肿，在同房时可能会导致子宫内膜脱落，从而出现棕色分泌物。
3.排卵期出血：如果女性处于排卵期，体内激素水平会发生变化，导致子宫内膜部分脱落，从而出现少量出血，血液在阴道内残留时间较长，就会出现棕色分泌物。
4.其他：如果女性在同房时动作过于粗暴，可能会导致阴道黏膜受损，从而出现棕色分泌物。
如果棕色分泌物持续时间较长或伴有其他不适症状，建议及时就医，进行相关检查，如白带常规、B超等，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。