乙肝的诊断鉴别主要通过血清学检测、病毒学检测等方法。一般来说，通过乙肝五项等检查可以初步判断是否感染乙肝病毒。
血清学检测方面
乙肝表面抗原检测：是诊断乙肝的重要指标之一，如果乙肝表面抗原呈阳性，提示可能感染了乙肝病毒。一般通过血液检测来进行该项检查。乙肝表面抗体检测：乙肝表面抗体是一种保护性抗体，阳性表示对乙肝有免疫力，可能是接种乙肝疫苗产生的，也可能是既往感染乙肝病毒后恢复产生的。
病毒学检测方面
乙肝病毒DNA检测：可以定量检测血液中乙肝病毒的含量，能反映病毒复制的活跃程度和传染性强弱。例如，乙肝病毒DNA定量越高，通常提示病毒复制越活跃，传染性越强。乙肝e抗原检测：乙肝e抗原阳性一般表示乙肝病毒复制活跃，传染性较强。若乙肝e抗原阴性，可能病毒复制相对不活跃，但也不能完全排除病毒复制。
影像学检查辅助鉴别
腹部超声检查：通过超声可以观察肝脏的大小、形态、实质回声等情况，有助于判断肝脏是否有病变，比如是否存在肝硬化等情况。在乙肝患者中，随着病情进展，可能会出现肝脏形态改变、实质回声不均匀等表现。肝脏CT或MRI检查：对于一些超声难以清晰判断的肝脏病变，CT或MRI检查可以提供更详细的肝脏结构信息，帮助鉴别肝脏是否有占位性病变等情况，辅助诊断乙肝相关的肝脏病变情况。