乙肝的诊断鉴别主要通过血清学检测、影像学检查等方式。一般来说，通过乙肝五项（乙肝表面抗原、乙肝表面抗体、乙肝e抗原、乙肝e抗体、乙肝核心抗体）等血清学检查能初步判断是否感染乙肝。比如乙肝表面抗原阳性就提示感染了乙肝病毒。
血清学检测方面
乙肝五项检测：乙肝表面抗原（HBsAg）是乙肝病毒感染的标志，若呈阳性说明感染了乙肝病毒。乙肝表面抗体（抗 - HBs）是保护性抗体，阳性表示对乙肝有免疫力，可能是接种疫苗后产生的，也可能是既往感染恢复后产生的。乙肝e抗原（HBeAg）阳性通常提示乙肝病毒复制活跃，传染性较强。乙肝e抗体（抗 - HBe）阳性一般意味着病毒复制活动减弱，传染性降低。乙肝核心抗体（抗 - HBc）包括IgM和IgG型，抗 - HBc IgM阳性常提示乙肝病毒处于复制状态，有传染性；抗 - HBc IgG阳性表示既往感染过乙肝病毒。乙肝病毒DNA检测：可以定量检测血液中乙肝病毒的含量，能更准确地反映病毒复制情况和传染性强弱。一般来说，数值越高，病毒复制越活跃，传染性越强。比如当乙肝病毒DNA定量大于1×10³IU/ml时，就提示病毒在体内有复制。
影像学检查方面
腹部超声检查：通过超声可以观察肝脏的大小、形态、实质回声等情况。在乙肝患者中，早期可能肝脏大小形态无明显异常，随着病情进展，可能会出现肝脏实质回声增粗、不均匀，脾脏增大等表现。比如慢性乙肝患者长期不愈，可能会逐渐出现肝纤维化甚至肝硬化的超声表现，如肝脏表面不光滑、肝实质回声不均、门静脉增宽、脾厚等。肝脏弹性测定：可以用于评估肝脏纤维化程度。通过检测肝脏的弹性值来判断肝纤维化的严重程度，例如采用瞬时弹性成像等方法，正常肝脏弹性值一般在一定范围内，当肝脏有纤维化时弹性值会升高，有助于医生判断病情的发展阶段。
肝功能检查方面
谷丙转氨酶（ALT）和谷草转氨酶（AST）：这两种酶是反映肝细胞损伤的重要指标。当肝细胞受到乙肝病毒侵害而受损时，ALT和AST会释放到血液中，导致血清中这两种酶的水平升高。一般来说，正常参考值范围内（不同检测方法略有差异），如果ALT或AST升高，往往提示肝脏有炎症活动。比如当ALT超过正常上限的2倍以上，且持续时间较长时，通常提示乙肝病毒正在引起明显的肝细胞损伤，需要进一步进行治疗等干预措施。