肛瘘存在复发的可能性，其复发情况受多种因素影响。
手术方式选择不当
若手术未准确找到内口，或瘘管处理不彻底，就易导致复发。例如，单纯切开瘘管可能无法解决复杂肛瘘的全部问题，使得残留的瘘管组织再次形成肛瘘。
术后护理不佳
术后创面感染会增加复发风险。患者若不注意肛周清洁，粪便等污染物容易进入创面，引发感染，影响创面愈合，进而可能导致肛瘘复发。对于儿童患者，家长需更细心护理肛周，保持清洁，否则更易因护理不当引发感染致复发。
基础疾病影响
患有糖尿病等基础疾病的患者，身体抵抗力较弱，创面愈合能力差，肛瘘复发几率相对较高。这类患者要积极控制基础疾病，以降低复发风险。
生活方式因素
长期饮酒、进食辛辣刺激食物等不良生活方式，会刺激肛周，影响创面恢复，增加肛瘘复发可能性。比如经常大量饮酒的患者，肛周受刺激后，肛瘘复发风险会上升。